Məhsullar

Hepatit C virusu (HCV), otoimmün hepatit (AIH) və birincili biliar siroz (PBC) kimi sirozlu qaraciyər xəstəliklərində patogen molekulyar yollar zəif xarakterizə olunur.Xəstəliyin patogenezində diferensial şəkildə ifadə olunan genlər çox vaxt vacibdir.Supression subtractive hibridization (SSH) diferensial şəkildə ifadə edilmiş mRNT transkriptləri üçün zənginləşdirən genom miqyasında bir yanaşmadır.Biz kəmiyyət real vaxt əks transkriptaz polimeraz zəncirvari reaksiya (RT-PCR) ilə birlikdə SSH istifadə edərək sirozda diferensial gen ifadəsinin yeni müşahidələrini aparmağı hədəflədik.HCV sirozu, AIH sirozu, PBC və xəstə olmayan qaraciyər toxumasında qaraciyər transkriptomları SSH tərəfindən araşdırıldı.Nəticədə tamamlayıcı DNT (cDNA) klonları nöqtə-blot hibridizasiyası ilə diferensial ifadə üçün yenidən yoxlanıldı və sonra ardıcıllıqla sıralandı.Seçilmiş gen ifadəsi real vaxt rejimində RT-PCR ilə ölçüldü.SSH-dən sonra 694 klon diferensial gen ifadəsi üçün yenidən yoxlanıldı, bunlardan 145-i ardıcıllaşdırıldı və 89 müxtəlif gendən törəmə tapıldı.Yeddi klon yalnız heç bir məlum funksiyası olmayan genləri kodlayan ifadə edilmiş ardıcıllıq etiketi (EST) ardıcıllığı ilə homoloji idi.Dörd genin yuxarı tənzimlənən ifadəsi real vaxt rejimində RT-PCR ilə təsdiqləndi: sirozun bütün formalarında transmembran 4 superfamilya üzvü 3 (tetraspanin CO-029), AIH sirozunda kirpi qarşılıqlı zülal (HIP) və xitinaz 3-like-1 (HC gp-39 və ya ykl-40) və HCV sirozunda arginin-qlutamik turşunun təkrarlanması (RERE).Tədqiq olunan bütün toxumalarda RERE gen polimorfizmləri və splice variantları müşahidə edilmişdir.Tetraspanin CO-029-un yuxarı tənzimlənməsi ilk növbədə safra kanallarının hüceyrələrində lokallaşdırılmışdır.Yekun olaraq, insan sirozunda diferensial gen ifadəsinin yeni müşahidələri SSH-dən istifadə edərək əsas kəşf vasitəsi kimi aparılmışdır.Xüsusilə, HCV ilə əlaqəli qaraciyər xəstəliyində RERE geninin və onun məhsullarının əlavə tədqiqatlarına zəmanət verilir.